Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr5P51682 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr5P51682 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr5P51682 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr5P51682 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr5P51682 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr5P51682 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr5P51682 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms