Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin1P35438 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Grin1P35438 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grin1P35438 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms