Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcdP28867 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms