Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa5P28312 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms