Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Defa3P28310 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa3P28310 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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