Protein–RNA interactions for Protein: P26450

Pik3r1, Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r1P26450 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pik3r1P26450 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pik3r1P26450 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms