Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Htr3aP23979 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr3aP23979 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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