Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxd8P23463 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxd8P23463 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms