Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PrkchP23298 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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