Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rpl13aP19253 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rpl13aP19253 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpl13aP19253 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl13aP19253 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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