Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb1P13372 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Vpreb1P13372 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms