Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa9P09631 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms