Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc8P09025 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxc8P09025 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms