Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pik3cdO35904 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms