Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pitx3O35160 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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