Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AlyrefO08583 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AlyrefO08583 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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