Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17078M0QW51 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm17078M0QW51 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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