Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3727J3QM54 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3727J3QM54 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms