Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Taf4bG5E8Z2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms