Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r39G3UWE6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms