Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srp72F8VQC1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srp72F8VQC1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms