Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm8247F6VRJ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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