Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm21977F6U3N7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm21977F6U3N7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm21977F6U3N7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Gm21977F6U3N7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm21977F6U3N7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Gm21977F6U3N7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm21977F6U3N7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm21977F6U3N7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm21977F6U3N7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm21977F6U3N7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gm21977F6U3N7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm21977F6U3N7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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