Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngap1F6SEU4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms