Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Pdzd2E9Q1M1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pdzd2E9Q1M1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pdzd2E9Q1M1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Pdzd2E9Q1M1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Pdzd2E9Q1M1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Pdzd2E9Q1M1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pdzd2E9Q1M1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
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