Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph10bE9PYQ0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph10bE9PYQ0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms