Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC035044E0CXF8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms