Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms