Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah3B2RWG3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms