Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7aB2RT54 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms