Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdc2B2RR83 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ythdc2B2RR83 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms