Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl41A2AUC9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms