Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rtf1A2AQ19 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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