Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tubb1A2AQ07 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms