Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prdm12A2AJ77 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms