Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
4930447F04RikA2AFR2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms