Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms