Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Npas3Q9QZQ0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms