Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms