Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pcsk1nQ9QXV0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms