Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Limd1Q9QXD8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Limd1Q9QXD8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms