Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd2apQ9JLQ0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd2apQ9JLQ0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms