Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx6Q9JKK1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx6Q9JKK1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms