Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl39Q9JKF7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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