Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pard6bQ9JK83 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms