Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tuba8Q9JJZ2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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