Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lmbr1Q9JIT0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms