Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cldn19Q9ET38 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cldn19Q9ET38 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn19Q9ET38 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn19Q9ET38 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn19Q9ET38 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn19Q9ET38 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn19Q9ET38 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn19Q9ET38 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn19Q9ET38 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn19Q9ET38 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cldn19Q9ET38 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cldn19Q9ET38 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Cldn19Q9ET38 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cldn19Q9ET38 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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