Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ropn1lQ9EQ00 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms