Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms